<mark id="bahkc"><acronym id="bahkc"></acronym></mark>

          国产精品久久久久久不卡_欧美激情精品久久_99久久免费精品国产72精品九九_精品熟人妻一区二区三区四区不卡_国产麻豆精品一区二区三区

          ?
          生物資訊

          Soft Matter:采用計(jì)算方法揭示膜蛋白的變構(gòu)轉(zhuǎn)運(yùn)過程

          作者:admin 來源:華南農(nóng)業(yè)大學(xué) 發(fā)布時(shí)間: 2011-05-06 08:03  瀏覽次數(shù):
          購買進(jìn)口儀器、試劑和耗材——就在始于2001年的畢特博生物 kjhfd.cn

           

          近期,華南農(nóng)業(yè)大學(xué)信息學(xué)院青年教師常珊博士的課題組在國際著名學(xué)術(shù)期刊Soft Matter雜志發(fā)表了研究論文。該論文報(bào)道了大腸桿菌巖藻糖(L-fucose)轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白(FucP)的構(gòu)象變化和轉(zhuǎn)運(yùn)過程的計(jì)算方法研究。

          膜蛋白在各種重要的生物學(xué)過程中起著關(guān)鍵的作用,轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白是膜蛋白中重要的組成部分,大多數(shù)代謝上重要的分子和無機(jī)離子都通過細(xì)胞膜上的轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白進(jìn)行輸運(yùn)。實(shí)驗(yàn)上通過結(jié)構(gòu)解析可以得到轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白瞬態(tài)的靜態(tài)結(jié)構(gòu),但轉(zhuǎn)運(yùn)過程往往伴隨著明顯的構(gòu)象變化。傳統(tǒng)的方法是通過分子動(dòng)力學(xué)來進(jìn)行平衡態(tài)的模擬,由于體系巨大,模擬的時(shí)間尺度一般在數(shù)十納秒左右,而膜轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白的實(shí)際轉(zhuǎn)運(yùn)過程尺度往往達(dá)到上百微秒量級(1微秒=1000納秒)。因此,對膜蛋白的變構(gòu)轉(zhuǎn)運(yùn)模擬仍然具有極大的挑戰(zhàn)性。

          該項(xiàng)研究采用計(jì)算的方法模擬了同向共轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白FucP轉(zhuǎn)運(yùn)變構(gòu)過程。實(shí)驗(yàn)僅解析了FucP的外開口結(jié)構(gòu),為了實(shí)現(xiàn)全過程模擬,作者首先采用結(jié)構(gòu)模建的方法構(gòu)建了內(nèi)開口狀態(tài)的FucP。通過采用疊代的粗?;W(wǎng)絡(luò)方法,計(jì)算模擬了膜蛋白FucP從外開口結(jié)構(gòu)向內(nèi)開口結(jié)構(gòu)變化的過程。該項(xiàng)研究與之前分子動(dòng)力學(xué)的平衡態(tài)分析結(jié)果一致,同時(shí)展示了分子動(dòng)力學(xué)模擬難以達(dá)到的整個(gè)轉(zhuǎn)運(yùn)的構(gòu)象變化過程。這種粗?;挠?jì)算模擬方法可以為膜蛋白的轉(zhuǎn)運(yùn)機(jī)制研究提供幫助。

          該研究工作得到國家自然科學(xué)基金委項(xiàng)目(11047183)、廣東高校優(yōu)秀青年創(chuàng)新人才培育項(xiàng)目(LYM10042)和華南農(nóng)業(yè)大學(xué)校長基金項(xiàng)目(5600-k09325)資助。

          購買進(jìn)口儀器、試劑和耗材——就在始于2001年的畢特博生物 kjhfd.cn

          所有試劑均用于科研 ???? 北京畢特博生物技術(shù)有限責(zé)任公司 版權(quán)所有
          服務(wù)熱線:010-82015225/400-833-9299 | 傳真:010-62015131 | E-mail:info@bitebo.com
          京ICP備05028556號-1 ??京公網(wǎng)安備11010802008747??

          亚洲av无码乱码在线观看裸奔_欧美激情精品久久_99久久免费精品国产72精品九九_精品熟人妻一区二区三区四区不卡

          <mark id="bahkc"><acronym id="bahkc"></acronym></mark>