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          生物資訊

          Cell Stem Cell:研究獲得成神經(jīng)細(xì)胞自我更新與分化功能網(wǎng)絡(luò)圖

          作者:Juergen Knoblich 來源:《細(xì)胞—干細(xì)胞》 發(fā)布時(shí)間: 2011-05-23 08:27  瀏覽次數(shù):
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          來自奧地利科學(xué)院分子生物化學(xué)研究所(IMBA)的研究人員利用全基因組RNAi掃描的方法,識(shí)別出了620個(gè)調(diào)控果蠅成神經(jīng)細(xì)胞自我更新與分化平衡的新基因,獲得了成神經(jīng)細(xì)胞自我更新與分化的功能性網(wǎng)絡(luò)圖。這對(duì)于進(jìn)一步了解神經(jīng)干細(xì)胞產(chǎn)生,及其發(fā)展的機(jī)制具有重要意義。這一研究成果公布在《細(xì)胞—干細(xì)胞》(Cell Stem Cell)雜志上。

           

          領(lǐng)導(dǎo)這一研究的是奧地利科學(xué)院著名的神經(jīng)干細(xì)胞專家Juergen A. Knoblich教授,這位科學(xué)家早年畢業(yè)于馬普研究院,之后曾在華裔美國(guó)科學(xué)院院士伉儷——詹裕農(nóng)(Yuh-Nung Jan) 葉公杼(Lily Yeh Jan)夫妻實(shí)驗(yàn)室從事研究工作。Knoblich教授研究組主要研究興趣是不對(duì)稱分子分裂的分子機(jī)制,他們利用果蠅了解蛋白如何在有絲分裂過程中決定不對(duì)稱分裂的。近年來,其研究組又從干細(xì)胞角度分析神經(jīng)發(fā)育。Knoblich教授曾獲得多個(gè)獎(jiǎng)項(xiàng),也發(fā)表過多篇文章,在Nature,Science,Cell等頂級(jí)刊物也發(fā)表過許多成果,其中的一些文章都是這一領(lǐng)域的經(jīng)典文章,比如他的一篇Cell文章就入選了Cell雜志引用次數(shù)最多的文章之一。

          干細(xì)胞自我更新與分化之間的平衡十分重要,需要精密調(diào)控,才能確保組織的動(dòng)態(tài)平衡,阻止腫瘤的發(fā)生。因此這方面的研究也倍受矚目,許多大型實(shí)驗(yàn)室也進(jìn)行了相關(guān)研究,比如之前哈佛醫(yī)學(xué)院,波士頓兒童醫(yī)院的研究人員就描述過胚胎干細(xì)胞自我更新與分化平衡維持機(jī)制。

          在這篇文章中,研究人員利用全基因組RNAi掃描,識(shí)別出了維持果蠅成神經(jīng)細(xì)胞自我更新與分化平衡的620個(gè)基因,并且一一找出了對(duì)應(yīng)的表型,包括增殖,細(xì)胞大小,細(xì)胞形狀,族系等方面。從中研究人員找到了一組對(duì)于自我更新十分重要的轉(zhuǎn)錄調(diào)控子,通過階層式分群方法(hierarchical clustering),結(jié)合交叉數(shù)據(jù),獲得了成神經(jīng)細(xì)胞自我更新與分化的功能性網(wǎng)絡(luò)圖。

          這些研究數(shù)據(jù)說明了染色質(zhì)重塑Brm復(fù)合物,剪接體,TRiC/CCT復(fù)合物的關(guān)鍵作用,也提出了可變剪接轉(zhuǎn)錄因子Lola和轉(zhuǎn)錄延長(zhǎng)因子Ssrp和Barc在成神經(jīng)細(xì)胞自我更新過程中的調(diào)控作用。而且通過在小鼠神經(jīng)干細(xì)胞中分析這些基因的作用,也豐富了我們對(duì)于哺乳動(dòng)物神經(jīng)生物學(xué)的了解。

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