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          生物資訊

          Cell:《細(xì)胞》期刊2011年度五大研究發(fā)現(xiàn)

          作者:towersimper 來(lái)源:生物谷 發(fā)布時(shí)間: 2012-01-11 11:15  瀏覽次數(shù):
          購(gòu)買進(jìn)口儀器、試劑和耗材——就在始于2001年的畢特博生物 kjhfd.cn

          1.利用誘導(dǎo)性多功能干細(xì)胞構(gòu)建出小鼠精子祖細(xì)胞

           

          日本京都大學(xué)研究人員通過(guò)體外誘導(dǎo)胚胎干細(xì)胞(ESCs)和誘導(dǎo)性多功能干細(xì)胞(iPSCs),形成原始生殖細(xì)胞樣細(xì)胞(primordial germ cell-like cells, PGCLCs),最后進(jìn)一步分化,通過(guò)體內(nèi)植入不能生育的小鼠睪丸中,產(chǎn)生了外觀正常的精子。將這些精子注射到雌性小鼠的卵細(xì)胞中,不久雌性小鼠生出了健康的小鼠后代。

          Katsuhiko Hayashi et al. Reconstitution of the Mouse Germ Cell Specification Pathway in Culture by Pluripotent Stem Cells. Cell,04 August 2011,146(4):519-532, doi:10.1016/j.cell.2011.06.052.

          2.鑒定出阿爾茨海默病Alzheimer's disease的生物標(biāo)記

          美國(guó)研究人員利用一種一般性和無(wú)偏差的方法---組合文庫(kù)篩選(Combinatorial Library Screening)來(lái)鑒定出診斷上有用的抗體,而避免進(jìn)行抗原鑒定。該方法涉及利用非自然的合成分子組合文庫(kù)對(duì)病人血清樣品和對(duì)照樣品進(jìn)行比較性篩選,這樣就可鑒定出病人血清樣品中要比和對(duì)照樣品中保留極其多IgG抗體的分子,隨后利用這些分子作為捕獲試劑來(lái)捕獲診斷上有用的抗體。研究人員利用多發(fā)性硬化癥(multiple sclerosis)小鼠模式動(dòng)物和證實(shí)這種方法的實(shí)用性,并利用該方法在阿爾茨海默病小鼠模式動(dòng)物中鑒定出兩種候選的IgG抗體生物標(biāo)記。

          M. Muralidhar Reddy et al. Identification of Candidate IgG Biomarkers for Alzheimer's Disease via Combinatorial Library Screening. Cell, 7 January 2011, 144(1):132-142, doi:10.1016/j.cell.2010.11.054.

          3.發(fā)現(xiàn)干細(xì)胞多能性的選擇性剪接開(kāi)關(guān)

          加拿大多倫多大學(xué)研究人員發(fā)現(xiàn)了進(jìn)化上保守的特異的FOXP1選擇性剪接開(kāi)關(guān),可調(diào)控干細(xì)胞的多能性。研究人員發(fā)現(xiàn)這種剪接開(kāi)關(guān)產(chǎn)生的FOXP1胚胎干細(xì)胞特異性異構(gòu)體,與典型的FOXP1異構(gòu)體相比,著不同的DNA結(jié)合性質(zhì)。選擇性剪接事件改變了FOXP1胚胎干細(xì)胞特異性異構(gòu)體的DNA結(jié)合性質(zhì),促進(jìn)維持多能性所需的轉(zhuǎn)錄因子基因的表達(dá),包括OCT4、NANOG、NR5A2和GDF3,同時(shí)抑制胚胎干細(xì)胞分化所需的基因。同時(shí),研究小組還發(fā)現(xiàn)FOXP1胚胎干細(xì)胞特異性異構(gòu)體促進(jìn)體細(xì)胞高效重編程為誘導(dǎo)性多功能干細(xì)胞(iPSC)。

          Mathieu Gabut et al. An Alternative Splicing Switch Regulates Embryonic Stem Cell Pluripotency and Reprogramming. Cell, 15 September 2011, 147(1):132-146,
          doi:10.1016/j.cell.2011.08.023.

          4.追蹤神經(jīng)膠質(zhì)瘤的起源

          美國(guó)研究人員利用雙標(biāo)記嵌合分析(Mosaic Analysis with Double Markers,MADM)---該技術(shù)的精髓在于用綠色熒光蛋白明確標(biāo)示突變細(xì)胞,還有一個(gè)關(guān)鍵特色就是無(wú)論一個(gè)突變的綠色細(xì)胞何時(shí)產(chǎn)生,總是同時(shí)產(chǎn)生一個(gè)正常的紅色細(xì)胞---來(lái)分析神經(jīng)膠質(zhì)瘤(glioma)的起源。他們將膠質(zhì)瘤病人體內(nèi)發(fā)現(xiàn)的兩種流行突變p53與NF1導(dǎo)入神經(jīng)干細(xì)胞(neural stem cells, NSCs)中,對(duì)源自神經(jīng)干細(xì)胞的所有細(xì)胞系所作的進(jìn)一步分析清楚地顯示了少突膠質(zhì)前體細(xì)胞(Oligodendrocyte precursor cells,OPCs)是該腫瘤的來(lái)源細(xì)胞,因?yàn)槿魏慰梢?jiàn)的腫瘤標(biāo)志可被檢出之前,變異的綠色少突膠質(zhì)前體細(xì)胞的數(shù)量大大超過(guò)了其正常的紅色對(duì)應(yīng)物數(shù)量,足足超了130倍。為了進(jìn)一步證實(shí)這點(diǎn),研究人員也將p53與NF1突變直接導(dǎo)入小鼠少突膠質(zhì)前體細(xì)胞,結(jié)果發(fā)現(xiàn)這些小鼠產(chǎn)生神經(jīng)膠質(zhì)瘤,從而再次證實(shí)少突膠質(zhì)前體細(xì)胞是神經(jīng)膠質(zhì)瘤的來(lái)源。

          Chong Liu et el. Mosaic Analysis with Double Markers Reveals Tumor Cell of Origin in Glioma. Cell, 07 July 2011,146(2):209-221,doi:10.1016/j.cell.2011.06.014.

          5.發(fā)現(xiàn)新的組蛋白修飾方式

          美國(guó)芝加哥大學(xué)Ben Mary癌癥研究所研究人員在細(xì)胞中篩查出了67個(gè)新組蛋白修飾標(biāo)記,并從中發(fā)現(xiàn)了一種新型組蛋白翻譯后修飾方式---賴氨酸巴豆酰化(lysine crotonylation)修飾。通過(guò)進(jìn)一步的結(jié)構(gòu)及基因組定位分析,研究人員證實(shí)氨酸巴豆?;揎検且环N進(jìn)化高度保守,且在生物學(xué)功能上完全不同于組蛋白賴氨酸乙?;牡鞍踪|(zhì)修飾方式。研究人員還發(fā)現(xiàn)在人類體細(xì)胞和小鼠精子細(xì)胞基因組中,組蛋白賴氨酸巴豆?;植加诨蚧钚赞D(zhuǎn)錄啟動(dòng)區(qū)域或增強(qiáng)子上。在減數(shù)分裂后的精子細(xì)胞中,賴氨酸巴豆酰化高豐度集中在性染色體上,被用來(lái)標(biāo)記睪丸特異性基因。(生物谷:towersimper編譯)

          Minjia Tan et al. Identification of 67 Histone Marks and Histone Lysine Crotonylation as a New Type of Histone Modification. Cell, 16 September 2011, 146(6):1016-1028, doi:10.1016/j.cell.2011.08.008.

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