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          生物資訊

          我國(guó)科學(xué)家解析人胞質(zhì)亮氨酰-tRNA合成酶的CP發(fā)卡結(jié)構(gòu)域

          作者:admin 來源:生化細(xì)胞所 發(fā)布時(shí)間: 2014-08-02 08:32  瀏覽次數(shù):
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           我國(guó)科學(xué)家解析人胞質(zhì)亮氨酰-tRNA合成酶的CP發(fā)卡結(jié)構(gòu)域

          示意圖:CP發(fā)卡結(jié)構(gòu)域在亮氨酰-tRNA合成酶的一級(jí)序列和三級(jí)結(jié)構(gòu)中的位置(紫色)

          亮氨酰-tRNA合成酶(LeuRS)催化亮氨酸和對(duì)應(yīng)tRNALeu之間的酯化反應(yīng)。亮氨酸和異亮氨酸、甲硫氨酸、正纈氨酸的結(jié)構(gòu)非常相似,亮氨酰-tRNA合成酶對(duì)上述氨基酸的辨別能力很低,有可能生成錯(cuò)誤的氨基酰-tRNALeu。在進(jìn)化中,亮氨酰-tRNA合成酶在原始的催化結(jié)構(gòu)域之上招募了新的編校結(jié)構(gòu)域,對(duì)誤氨基?;a(chǎn)物進(jìn)行水解,確保蛋白質(zhì)翻譯過程正確進(jìn)行。連接催化結(jié)構(gòu)域和編校結(jié)構(gòu)域之間的氨基酸序列被稱為CP發(fā)卡結(jié)構(gòu)域。人們普遍認(rèn)為,這一結(jié)構(gòu)域可能維持酶的空間結(jié)構(gòu),并參與了酶催化過程中的構(gòu)象變化,然而對(duì)其細(xì)節(jié)知之甚少。

          來自王恩多研究組的科研人員黃騫等刪除了人胞質(zhì)亮氨酰-tRNA合成酶的CP發(fā)卡結(jié)構(gòu)域,發(fā)現(xiàn)酶的氨基酸活化能力和氨基?;芰ν耆珕适?,tRNA結(jié)合能力極大削弱,而編校功能幾乎不受影響。他們構(gòu)建了一系列原核、真核和古細(xì)菌的嵌合體亮氨酰-tRNA合成酶,發(fā)現(xiàn)只有來自于真核生物酵母的亮氨酰-tRNA合成酶CP發(fā)卡結(jié)構(gòu)域可以替代人胞質(zhì)亮氨酰-tRNA合成酶CP發(fā)卡結(jié)構(gòu)域的功能。通過結(jié)構(gòu)和序列分析他們發(fā)現(xiàn),這一結(jié)構(gòu)域的柔性氨基酸殘基參與了酶催化過程中的構(gòu)象變化,對(duì)于酶的氨基酸活化能力和氨基?;芰Φ陌l(fā)揮至關(guān)重要,而極性氨基酸殘基則負(fù)責(zé)酶與tRNALeu的結(jié)合過程。

          這一結(jié)果有助于人們更好的了解亮氨酰-tRNA合成酶的催化原理,發(fā)現(xiàn)人胞質(zhì)亮氨酰-tRNA合成酶和致病菌亮氨酰-tRNA合成酶的結(jié)構(gòu)差異,有針對(duì)性的設(shè)計(jì)新的抗生素藥物。

          該項(xiàng)工作得到了國(guó)家科技部,國(guó)家基金委和中國(guó)博士后科學(xué)基金會(huì)的支持。

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